ที’ชัลลา (Chadwick Boseman) กษัตริย์แห่งวากานดา กำลังจะเสียชีวิตจากโรคร้ายระยะสุดท้ายที่ไม่ทราบสาเหตุ ซึ่งชูริ (Letitia Wright) น้องสาวของเขา เจ้าหญิงแห่งวากานดาและผู้ออกแบบเทคโนโลยีให้ประเทศ เชื่อว่าสามารถรักษาได้ด้วย “สมุนไพรดอกหัวใจ” (Heart-Shaped Herb) ชูริพยายามสังเคราะห์สมุนไพรขึ้นมาใหม่หลังจากมันถูกทำลายโดยเอริก คิลมองเกอร์ (Michael B. Jordan) แต่ก็ไม่สำเร็จก่อนที่ที’ชัลลาจะเสียชีวิต
หนึ่งปีต่อมา วากานดาถูกประเทศต่าง ๆ กดดันให้แบ่งปันไวเบรเนียม และบางฝ่ายถึงกับพยายามแย่งชิงด้วยกำลัง ราชินีราโมนดา (Angela Bassett) ผู้ปกครองวากานดาที่กำลังโศกเศร้ากับการตายของลูกชาย ขอให้ชูริทำวิจัยสมุนไพรต่อเพื่อสร้างแบล็กแพนเธอร์คนใหม่มาปกป้องประเทศ แต่ชูริปฏิเสธเพราะเชื่อว่าแบล็กแพนเธอร์เป็นสัญลักษณ์ของอดีต
ในมหาสมุทรแอตแลนติก CIA และหน่วย Navy SEAL ของสหรัฐใช้เครื่องตรวจจับไวเบรเนียมเพื่อค้นหาแหล่งแร่ใต้น้ำ แต่คณะสำรวจถูกสังหารโดยกลุ่มมนุษย์เหนือมนุษย์ผิวสีน้ำเงินที่หายใจใต้น้ำได้ นำโดยนาเมอร์ (Tenoch Huerta Mejía) กษัตริย์แห่งทาโลคาน อารยธรรมโบราณใต้ทะเล โดย CIA เข้าใจผิดว่าวากานดาเป็นผู้อยู่เบื้องหลัง นาเมอร์บุกเข้าพบราโมนดาและชูริอย่างง่ายดายผ่านระบบรักษาความปลอดภัย และโทษว่าวากานดาเป็นต้นเหตุของการแข่งขันไวเบรเนียม พร้อมยื่นคำขาดให้ส่งตัวนักวิทยาศาสตร์ผู้สร้างเครื่องตรวจจับ มิฉะนั้นเขาจะโจมตีวากานดา พร้อมอ้างว่ากองทัพของเขามีอำนาจมหาศาล
ชูริและโอโคเย (Danai Gurira) แม่ทัพหน่วยโดรา มิลาเจ ได้รู้จากเจ้าหน้าที่ CIA เอเวอเร็ตต์ รอสส์ (Martin Freeman) ว่านักวิทยาศาสตร์คนนั้นคือริริ วิลเลียมส์ (Dominique Thorne) นักศึกษา MIT และอัจฉริยะนักประดิษฐ์จากชิคาโก ผู้สร้างชุดเกราะระดับเดียวกับไอรอนแมน ทั้งคู่เดินทางไปพบเธอ ขณะเดียวกันถูก FBI และนักรบของนาเมอร์ตามล่า นักรบทาโลคานเอาชนะโอโคเยและพาชูริกับริริลงใต้ทะเลไปพบกษัตริย์นาเมอร์ ราโมนดาโกรธที่โอโคเยปกป้องชูริไม่ได้ จึงปลดเธอจากตำแหน่ง และไปขอความช่วยเหลือจากนาเคีย (Lupita Nyong’o) อดีตสายลับวอร์ด็อกที่อาศัยอยู่ในเฮติหลังเหตุการณ์บลิป
นาเมอร์พาชูริชมอาณาจักรทาโลคานที่อุดมด้วยไวเบรเนียม ซึ่งเขาปกป้องจากโลกภายนอกมาหลายศตวรรษ เขาเล่าว่าในปี ค.ศ.1571 ผู้พิชิตสเปนนำโรคและสงครามมาสู่ชาวพื้นเมือง หมอผีได้รับนิมิตและพบพืชสีน้ำเงิน จึงบดให้ชาวเผ่ากิน ทำให้หายใจอากาศไม่ได้แต่หายใจในน้ำได้ แม่ของนาเมอร์ที่กำลังตั้งครรภ์กินพืชนั้น นาเมอร์จึงเกิดในน้ำ มีปีกที่ข้อเท้าและเป็นมนุษย์กลายพันธุ์ ต่อมาเขากลับไปฝังแม่และสังหารผู้ตั้งถิ่นฐานยุโรป จนถูกนักบวชเรียกว่า “ปีศาจ” หรือ “นาเมอร์”
ด้วยความแค้นต่อโลกผิวดินที่เคยกดขี่ชาวมายา นาเมอร์เสนอพันธมิตรกับวากานดาเพื่อต่อต้านโลกภายนอก แต่ขู่ว่าจะทำลายวากานดาหากปฏิเสธ นาเคียช่วยชูริและริริหนีโดยสังหารทหารทาโลคานคนหนึ่ง ทำให้นาเมอร์ตอบโต้ด้วยการโจมตีวากานดา และราโมนดาเสียชีวิตจากการจมน้ำขณะช่วยริริ นาเมอร์ประกาศว่าจะกลับมาพร้อมกองทัพเต็มกำลังในหนึ่งสัปดาห์ ชาววากานดาจึงอพยพไปยังภูเขาจบารี ขณะเดียวกันรอสส์ถูกอดีตภรรยา วาเลนตินา อัลเลกรา เดอ ฟงแตน ผู้อำนวยการ CIA จับกุมเพราะให้ข้อมูลลับแก่วากานดา
หลังพิธีศพราโมนดา ชูริใช้เศษพืชต้นกำเนิดพลังของชาวทาโลคานที่อยู่ในกำไลของนาเมอร์ สร้างสมุนไพรดอกหัวใจขึ้นใหม่ เธอดื่มมันและได้พลังเหนือมนุษย์ (แม้หัวใจหยุดเต้นชั่วคราว) และในแดนวิญญาณได้พบคิลมองเกอร์ซึ่งยุให้แก้แค้น เธอสวมชุดแบล็กแพนเธอร์ใหม่และได้รับการยอมรับจากเผ่าวากานดา แม้เอ็ม’บาคูจะเสนอให้เจรจา แต่ชูริตั้งใจแก้แค้นการตายของแม่และสั่งโจมตีทาโลคานทันที โดยให้อาโยรับตำแหน่งแม่ทัพโดรา มิลาเจ และมอบชุดเกราะ Midnight Angel ให้โอโคเย พร้อมดึงอาเนกะเข้าร่วม ขณะที่ริริสร้างชุดเกราะคล้ายไอรอนแมนช่วยรบ
วากานดาล่อกองทัพนาเมอร์ขึ้นสู่ผิวน้ำด้วยเครื่องตรวจจับไวเบรเนียม เกิดการต่อสู้ ชูริขังนาเมอร์ในเครื่องบินรบเพื่อทำให้ร่างแห้งและอ่อนกำลัง ทั้งคู่ตกลงบนชายหาดทะเลทรายและต่อสู้กัน ชูริได้เปรียบแต่เห็นภาพนิมิตของราโมนดา จึงขอให้นาเมอร์ยอมแพ้และเสนอพันธมิตรสันติภาพ นาเมอร์ยอมรับ การต่อสู้จึงยุติ แม้นาโมราจะไม่พอใจ นาเมอร์เชื่อว่าพันธมิตรนี้จะทำให้พวกเขายึดโลกผิวดินได้ในอนาคต
ริริกลับ MIT โดยทิ้งชุดเกราะไว้ โอโคเยช่วยรอสส์หนี ชูริปลูกสมุนไพรดอกหัวใจใหม่เพื่อสืบทอดตำแหน่งแบล็กแพนเธอร์ ระหว่างที่ชูริไม่อยู่ เอ็ม’บาคูก้าวขึ้นท้าชิงบัลลังก์ ชูริไปเยือนนาเคียที่เฮติและเผาชุดงานศพตามความประสงค์ของราโมนดา เพื่อยอมรับการสูญเสียที’ชัลลาในที่สุด
ฉากหลังเครดิตเผยว่า นาเคียและที’ชัลลามีลูกชายชื่อ ตูแซงต์ ซึ่งเธอเลี้ยงดูอย่างลับ ๆ และเด็กชายบอกว่าชื่อวากานดาของเขาคือ “ที’ชัลลา”
